在群体基因组商榷中色人阁影院，构建一个高质料、代表性强的参考基因组面板（reference panel）是晋升基因型填充精度的关节。牛和猪等经济动物已诀别成立圭表化参考资源，灵验推进了数目性状位点（QTL）剖析和候选基因识别的施展。比拟之下，看周详球饲养量最大的家禽——鸡，此前尚短缺一套隐私无为、样本实足、可支握多场景操纵的高质料参考面板。

为填补这一空缺，商榷团队发起并构建了全球首个10万领域鸡参考面板形势——100K GCRP（Global Chicken Reference Panel）。第一阶段着力于2025年4月15日，在Genomics， Proteomics & Bioinformatics杂志在线发表，题为“GCRP: Integrated Global Chicken Reference Panel from 11，951 Chicken Genomes” 。

该商榷由中国农业大学胡晓湘和王宇哲团队牵头，勾通国表里多个单元互助完成，第一阶段着力构建了全球首个鸡类参考基因组资源库，有望为鸡种遗传变异图谱构建、东说念主工遴荐商榷和精确育种提供基础撑握。

在此项商榷中，华大智造DNBSEQ-T7基因测序平台以及MGISP-960高通量自动化样本制备系统、MGISTP-7000分杯处理系统为形势组提供了从样本处理到基因测序的系统支握。畜禽全基因组遴荐经常濒临着样本量繁多、老本条款尖刻等问题，华大智造一站式搞定平台的业务样式正好简略搞定这一选藏，华大智造超高通量基因测序仪匹配自动化产线，一方面简略在样本处理和建库通量上已毕高通量、高着力、低老本，另一方面也大大裁减了时期老本，进一步匹配畜禽育种的产业需求。

据了解，鸡的驯化历史可回想至约8000年前，发祥于散布在南亚和东南亚的原鸡（Gallus gallus）。原鸡不仅是首个完周详基因组测序的鸟类，亦然最早被解码的脊椎动物基因组之一。现在，民众变异数据库（如 dbSNP v106）已收录约2343万个单核苷酸多态性位点（SNP）和240万个短插入/缺失变异（InDel），为鸡的基因组关连分析（GWAS）和功能基因挖掘提供了迫切基础。

跟着低深度测序（LCS）时代的发展，商榷者得以在截止老本的同期已毕大领域样本测序，弥补传统SNP芯片信息隐私不及的局限，为基因组遴荐与抽象化变异定位提供了新可能。

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第一阶段着力给与低深度测序赢得了 10104 份商品鸡样本，此外征集了1847个高尚度测序样本，构建了两个高质料子面板（CBP 与 CMP），系统评估了不同政策下的基因型填充性能，并在模拟与委果性状中展示了其在 GWAS 和因果变异定位中的上风。该资源库有望为鸡种遗传变异图谱构建、东说念主工遴荐商榷和精确育种提供基础撑握。

中国农业大学胡晓湘解释示意，领先操纵低深度重测序时代时给与了入口测序平台，但过程测序实测数据的对比，华大智造测序仪的数据准确性和数据质料与入口仪器相当，况且华大智造测序仪的Duplication rate（类似序列率）赫然低于入口平台，这将有助于得到更多的灵验数据用于后续分析。

不仅如斯色人阁影院，华大智造测序平台以更低老本简略开释更多测序后劲，老本与着力的“双冲突”成为其在2018年切换为华大智造测序平台的迫切初志。大设施遗传系统依然造成了操纵低深度重测序时代年处理100万样本的领域。华大智造不仅提供测序仪器，还提供一系列自动化征战配套，已毕从提真金不怕火建库到测序的全产业链闭环的生态系统。将来，还将依托于华大智造测序平台将这一时代实施到主要的猪鸡等经济动物家禽的育种企业。